Trung tâm Giáo dục thường xuyên thành phố Cần Thơ được tổ chức lại theo Quyết định số 2272/QĐ-UBND ngày 22 tháng 9 năm 2023 của Uỷ ban nhân dân thành phố Cần Thơ về việc tổ chức lại Trung tâm Ngoại ngữ - Tin học và Bồi dưỡng nhà giáo thành Trung tâm Giáo dục thường xuyên thành phố Cần Thơ.
Trung tâm Giáo dục thường xuyên thành phố Cần Thơ là đơn vị sự nghiệp công lập trực thuộc Sở Giáo dục và Đào tạo thành phố Cần Thơ, chịu sự chỉ đạo, quản lý trực tiếp về tổ chức, biên chế và hoạt động của Sở Giáo dục và Đào tạo thành phố Cần Thơ.
Trung tâm Giáo dục thường xuyên thành phố Cần Thơ là đơn vị công lập tự đảm bảo chi thường xuyên, thực hiện cơ chế tự chủ tài chính theo quy định tại Nghị định số 60/2021/NĐ-CP ngày 21 tháng 6 năm 2021 của Chính phủ quy định cơ chế tự chủ tài chính của đơn vị sự nghiệp công lập.